paad/action/action_usuario.php

<?php
$ruta = "../";
require_once '../class/c_login.php';

// print_r($_POST); exit;

if (($user = Login::validUser($_POST['username'], $_POST['passwd'])) === false) {
    echo json_encode("error");
    exit;
}

$facultades = queryAll("SELECT DISTINCT ID, FACULTAD FROM FS_FACULTAD WHERE ACTIVA");

for ($i = 0; $i < count($facultades); $i++) {
    # print_r($facultades[$i]);
    $facultades[$i]['usuarios'] = queryAll(
        "SELECT ID, USERNAME FROM FS_USUARIO WHERE facultad = :facultad",
        array(":facultad" => $facultades[$i]["id"])
    );
}

echo json_encode($facultades);